C18色譜柱選用的基本原則：
（1）選用經過烷基化處理封口的填料可防止堿性化合物的拖尾現象。
（2）選用含碳量高的柱子，增加保留值。
（3）選用較短的柱子。
（4）選用小顆粒度的填料。
（5）對分子量大的組分選用大孔徑填料的柱子。
C18色譜柱在日常使用過程中應注意的事項：
（1）柱子在裝卸、更換時，動作要輕，接頭擰緊要適度。必須防止較強的機械振動，以免柱床產生空隙。
（2）如果儀器用來做常規分析，樣品種類有限，但分析次數多，則不妨為每一類常規分析配置1根專用柱，這樣有助于延長柱子的壽命。
（3）如使用柱溫控制裝置時，應注意在通入流動相后才能升溫。
（4）流動相使用前需進行脫氣處理，以免降低柱效和影響檢測等。樣品溶液需經適當的前處理及過濾，以減少柱污染和堵塞。
（5）在更換流動相種類時，應注意溶劑的互溶性，防止發生鹽析現象。
（6）柱子的實際操作壓力應低于填裝時的較高壓力，在高壓力一半以下。
（7）屬非極性鍵合相色譜柱，流動相的pH值應嚴格控制在一定區間之間，以免損壞柱子。
（8）在完成分離分析工作之后，不應立即停機，需及時對色譜分析系統進行沖洗，以除去色譜柱內的雜質。
（9）如果流動相中有鹽類，首先用水充分清洗。如果是胺類添加到流動相中，要用甲醇和磷酸溶液混合溶劑沖洗，不要只用水沖洗。
（10）C18一般用甲醇作為保存溶劑，以防柱子干裂而損壞。嚴禁水或緩沖溶液長時間在色譜流路中保留。
（11）選用合適的C18保護柱，以保護分析柱免受雜質顆粒及不可逆吸附的干擾物的影響。保護柱內裝填料顆粒度應與分析柱填料的顆粒度盡量一致。
